Cómo apoya un proyecto
La planificación parte de secuencia y sitio exactos y alinea estereoquímica, bloques de síntesis protegidos, instalación, escisión, purificación y confirmación del sitio.
Definir el péptido modificado completo
Lipidación, glicosilación, PEGilación, ciclación, grapado y marcadores requieren residuo o extremo, enlace, estereoquímica y protección exactos. Cambiar el sitio puede cambiar síntesis, purificación, conformación, solubilidad y comportamiento.
La instalación puede usar aminoácido premodificado, paso sobre resina, conjugación en solución, ligación o enzima. La ruta depende de longitud, cadenas laterales, estabilidad, hidrofobicidad, agregación y compatibilidad de escisión.
Flujo habitual
Definir el constructo
Secuencia, extremos, estereoquímica, disulfuros/ciclación, residuos no canónicos y sitios.
Elegir ruta de instalación
Monómero modificado, protección ortogonal, sobre resina, después de la escisión, ligación o enzima.
Ajustar protecciones
Protecciones, reactivos, base, ácido, oxidación/reducción y estabilidad.
Planificar segmentos difíciles
Regiones hidrofóbicas, residuos glicosilados/lipidados, puntos de ciclo o ligación.
Planificar purificación
Anfifilicidad, deleciones, epimerización, heterogeneidad, solubilidad, contraión y almacenamiento.
Confirmar el péptido
Identidad, pureza, masa, sitio, estereoquímica/glicoforma, cierre, agregación y función.
Información necesaria antes de seleccionar
Secuencia y topología
Secuencia, extremos, estereoquímica, disulfuros, forma y ligación.
Mapa de modificaciones
Sitio de cada lípido, glycan, PEG, staple, cross-link, dye, biotina, click o aminoácido no canónico.
Forma química
Identidad, enlazador, enlace, protección, sal/contraión y formas relacionadas.
Restricciones
Ruta, condiciones prohibidas, oxidación, solubilidad, escala, purificación y forma.
Ensayos
Identidad, pureza, masa, sitio, estereoquímica, glycan/lípido, cierre, solubilidad y función.
Alcance
Cubre bloques de síntesis protegidos, grupos reactivos de lipidación/PEGilación, residuos glicosilados, herramientas de ciclación/grapado e intermedios. No afirma mejorar potencia, permeabilidad, estabilidad, vida media, selectividad, eficacia o seguridad.
Consideraciones clave
- Lipidación y espaciadores grasos
- Aminoácidos glicosilados
- grapado, ciclación y residuos preparados para química click
Catálogo y páginas técnicas relacionadas
Fuentes
- 1.Synthesis of proteins by native chemical ligation (Science, 1994)
- 2.Solid-phase synthesis of CD52 glycopeptide and an efficient route to Asn-core pentasaccharide conjugate (Bioorganic & Medicinal Chemistry, 1997)
- 3.Simultaneous lipidation of a characterized peptide mixture by chemoselective ligation (Bioconjugate Chemistry, 2003)
- 4.Activation of apoptosis in vivo by a hydrocarbon-stapled BH3 helix (Science, 2004)