CHEMOS
Chimie de procédé

Chimie du phosphore

Phosphoramidites, dérivés phosphonate, réactifs de phosphorylation et intermédiaires contenant du phosphore.

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Comment cela soutient un projet

Le projet définit état d’oxydation, liaisons P-O/P-N/P-S/P-C, protection, stéréochimie du phosphore, sensibilité, transformation suivante et analyses. Phosphoramidites, phosphates, phosphonates, phosphoramidates et phosphorothioates ne sont pas interchangeables.

Définir l’espèce avant la voie

Les phosphoramidites P(III), précurseurs activés pour oligos, sont sensibles à l’eau et à l’oxydation. Phosphates P(V), phosphonates P-C, phosphoramidates P-N et analogues soufrés nécessitent précurseurs, activation, protection, oxydation/sulfurisation, contrôle d’hydrolyse et isolement différents.

Le phosphore peut être stéréogène. Si la configuration compte, il faut fixer isomère unique, ratio contrôlé ou mélange et méthode de mesure. Une pureté générale ne remplace pas cette définition.

Flux type

1

Définir la structure

Oxydation, liaisons, protection, charge, contre-ion, stéréochimie et forme.

2

Choisir précurseur et activation

Adapter réactif de phosphitylation, phosphorylation, phosphonylation ou autre au partenaire et à l’étape suivante.

3

Contrôler eau et oxygène

Sécheresse, atmosphère, transfert, matériaux, temps d’attente et prélèvement pour P(III).

4

Planifier ordre et oxydation

Coordonner couplage, oxydation/sulfurisation, capping/arrêt de réaction, déprotection, hydrolyse et isolement.

5

Établir l’analyse du phosphore

LC/GC, MS, NMR dont 31P, eau, teneur et étalons pour hydrolyse, oxydation et isomères.

6

Confirmer isolement et stockage

Purification, forme, eau/solvant, emballage, température, stabilité et compatibilité suivante.

Informations requises

Identité exacte

Structure, oxydation, liaisons, protection, charge, contre-ion et stéréochimie.

Réaction suivante

Partenaire, activation, oxydation/sulfurisation, déprotection, clivage et groupes à préserver.

Manipulation

Sensibilité eau, oxygène, lumière, chaleur, acide/base; solvants, transfert et stockage.

Échelle et forme

Quantité, concentration/solution, sel ou forme libre, emballage, température et durée d’usage.

Spécification

Identité, teneur/pureté, eau, résidus, oxydation/hydrolyse, isomères, contre-ion et stabilité.

Périmètre

Couvre évaluation et travail convenu pour blocs de synthèse phosphorés, phosphoramidites, dérivés phosphonate/phosphate et réactifs ou intermédiaires associés. N’implique pas tous réactifs, formats stéréochimiques, fabrication d’oligos, performance fixe, durée de vie, échelle, spécification ou statut réglementaire. Chaque matériau est confirmé après revue.

Catalogue et pages techniques associés

Matériaux oligonucleotidesPhosphoramidites, nucleosides, supports et réactifs.Programmes oligonucleotidesSéquence, modifications, backbone, support, conjugaison et analyse.Modification des oligonucleotidesMonomères, support, backbone, fonctions réactives et déprotection.Procédé de synthèse des oligosCouplage, oxydation/sulfurisation, capping, clivage et analyse.Méthodes analytiquesEspèces phosphorées, pureté, eau, résidus, isomères et stabilité.

Sources

  1. 1.Deoxynucleoside phosphoramidites—A new class of key intermediates for deoxypolynucleotide synthesis (Tetrahedron Letters, 1981)
  2. 2.On-demand synthesis of phosphoramidites (Nature Communications, 2021)
  3. 3.Synthesis of Substituted Cy5 Phosphoramidite Derivatives and Their Incorporation into Oligonucleotides Using Automated DNA Synthesis (ACS Omega, 2022)
  4. 4.Convergent Deboronative and Decarboxylative Phosphonylation Enabled by the Phosphite Radical Trap BecaP (Journal of the American Chemical Society, 2023)