Comment cela soutient un projet
La sélection part du design complet : séquence, carte positionnelle, backbone, support 3′, extrémités, fonctions réactives internes, clivage, déprotection et analyse.
Traduire le design en exigences
Un nom de modification ne définit pas un oligo. Chaque résidu est affecté à une position et un brin; backbone, extrémités, surplombs, support/espaceur 3′ et sites de conjugaison sont aussi définis.
Monomères protégés, support, oxydation ou sulfurisation, capping, clivage et déprotection doivent être compatibles. Fluorophore, lipide, GalNAc, cholestérol ou click modifient aussi support, protection, purification et analyse.
Flux type de définition
Définir chaque brin
Séquence, orientation, rôle, longueur, surplombs et format.
Cartographier les modifications
Affecter sucre, base, backbone, stéréochimie, extrémités et modifications internes.
Choisir monomères et support
Adapter phosphoramidites ou autres monomères et support/espaceur 3′ au construct.
Fixer cycle et déprotection
Définir couplage, capping, oxydation/sulfurisation, clivage et déprotection compatibles.
Planifier la conjugaison
Définir ligand/marqueur, position, segment espaceur, paire, étape et purification.
Définir l’analyse
Identité, pureté, masse, modification, espèces apparentées, duplex et forme du matériau.
Informations requises avant la sélection
Carte complète
Séquence et positions des modifications sucre, base, backbone, extrémités, surplombs et conjugaison.
Format de synthèse
DNA, RNA ou mixte, nombre de brins, échelle, support/3′ et forme.
Contraintes de procédé
Protections, activation, oxydation/sulfurisation, clivage, déprotection, solvant, température.
Conjugué
ligand, lipide, dye, biotine, chélateur ou fonction réactive click exact; position, segment espaceur et ordre.
Spécification analytique
Identité, pureté, masse, modification, résidus, contre-ion, eau et stockage.
Périmètre de la plateforme
Elle couvre monomères, supports, réactifs de synthèse, fonctions réactives et blocs de synthèse de conjugaison. Design de séquence, choix de cible, prédiction d’activité, vectorisation validé, efficacité, sécurité et aptitude clinique ou réglementaire sont exclus.
Points clés
- Blocs de synthèse 2'-OMe, 2'-F, LNA, MOE et apparentés
- Modifications backbone et terminales
- fonctions réactives GalNAc, lipide, dye et click
Catalogue et pages techniques associés
Sources
- 1.Sustainability Challenges and Opportunities in Oligonucleotide Manufacturing (Journal of Organic Chemistry, 2021)
- 2.Solid-phase supports for oligonucleotide synthesis (Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, 2013)
- 3.The chemical evolution of oligonucleotide therapies of clinical utility (Nucleic Acids Research, 2017)
- 4.Bioconjugated Oligonucleotides: Recent Developments and Therapeutic Applications (Molecules, 2019)