Comment cela soutient un projet
Le choix part de la paire exacte, matrice, concentration, durée et stabilité des deux fonctions réactives. Bioorthogonal ne signifie pas adapté à tout échantillon.
Choisir une paire précise
SPAAC relie azide et cyclooctyne sans cuivre; IEDDA relie souvent tétrazine et TCO; CuAAC relie azide et alcyne terminal avec cuivre et exige une revue du catalyseur, ligand, réducteur, retrait et compatibilité.
La vitesse n’est qu’une variable. Stabilité, hydrolyse ou isomérisation, taille, hydrophobie, interactions non spécifiques, concentration et stabilité du produit affectent le flux. Le dérivé exact compte.
Flux type
Définir les deux partenaires
Préciser biomolécule, surface, matériau, marqueur ou charge et groupes dont la fonction doit rester.
Choisir les fonctions réactives
Sélectionner azide-cyclooctyne, tétrazine-TCO, azide-alcyne terminal ou autre paire validée.
Attribuer les fonctions réactives
Considérer taille, hydrophobie, synthèse, stockage, exposition et effet sur la fonction.
Définir l’installation
Préciser site ou distribution, segment espaceur, protections, ordre et purification.
Réagir avec témoins
Fixer stœchiométrie, concentration, milieu, pH, température, durée et témoins négatifs.
Caractériser produit et fonction
Confirmer conversion, identité, partenaires libres, sous-produits, site, stabilité et fonction.
Informations requises avant la sélection
Environnement
Tampon, lysat, cellule vivante, surface, polymère, particule ou autre matrice et conditions.
Partenaires
Identité, sites, quantité, formulation, taille et sensibilité au cuivre, réducteur, solvant, lumière ou oxydation.
Cinétique
Concentrations, durée acceptable, fenêtre de marquage et méthode de mesure.
Stabilité des fonctions réactives
Durée de vie, stockage, exposition aqueuse et risques d’isomérisation, réduction, oxydation, hydrolyse ou réaction parasite.
Plan analytique
Installation, conversion, réactifs libres, identité, site, stabilité et fonction.
Périmètre de la plateforme
La plateforme couvre blocs de synthèse azide, alcyne, cyclooctyne, tétrazine, TCO et planification. Elle n’affirme pas bioorthogonalité universelle, vitesse dans la matrice, conversion quantitative, spécificité, compatibilité cellulaire, imagerie, activité, sécurité ou usage clinique/réglementaire.
Points clés
- Sélection de fonctions réactives SPAAC
- Planification de paires IEDDA
- fonctions réactives de marquage et immobilisation
Catalogue et pages techniques associés
Sources
- 1.A strain-promoted [3 + 2] azide-alkyne cycloaddition for covalent modification of biomolecules in living systems (Journal of the American Chemical Society, 2004)
- 2.Copper-free click chemistry for dynamic in vivo imaging (Proceedings of the National Academy of Sciences, 2007)
- 3.Tetrazine ligation: fast bioconjugation based on inverse-electron-demand Diels-Alder reactivity (Journal of the American Chemical Society, 2008)
- 4.Conformationally Strained trans-Cyclooctene with Improved Stability and Excellent Reactivity in Tetrazine Ligation (Chemical Science, 2014)