如何支持项目
选料应从完整序列和修饰位点图开始,再确定保护单体、固相载体、骨架化学、末端手柄、脱保护条件和分析方案。
按完整流程确定材料
多数合成寡核苷酸采用固相逐步组装。亚磷酰胺循环通常重复脱三苯甲基、偶联、氧化或硫化、封端等步骤,直至链组装完成。修饰单体和功能手柄必须与所选偶联及脱保护条件相容。
因此,物料清单不能只根据碱基序列生成。糖和碱基修饰、骨架连接、3′ 端结构,以及末端或内部偶联位点,都会影响单体、载体、试剂和纯化方案。
典型化学流程
1
定义完整结构
记录序列、链型、糖和碱基修饰、骨架连接方式、两端结构及计划使用的偶联位点。
2
选择单体和固相载体
根据目标 3′ 端和预定切割条件,匹配保护亚磷酰胺、载体或载体连接臂。
3
确定组装化学
选择与修饰砌块相容的偶联、氧化或硫化、封端和脱三苯甲基条件。
4
规划切割、脱保护和纯化
核对保护基相容性,并明确如何分离全长产物、截短序列和未完全脱保护物。
5
按需偶联并确认产物
配体或功能手柄可在固相组装期间引入,也可在合成后偶联;完成后应确认身份和纯度。
选料前需要提供的信息
序列与修饰位点图
逐位标明糖、碱基、核苷间连接和末端修饰,不能只提供碱基序列。
3′ 端结构
明确 3′ 端残基或功能基团,因为这会决定固相载体或载体连接臂。
骨架连接模式
标明磷酸二酯和硫代磷酸酯连接的位置,以便安排氧化和硫化步骤。
偶联方案
明确连接位置、配体或标记物、间隔臂、反应对,以及其与组装和脱保护条件的相容性。
分析要求
根据项目所处研究阶段确定身份、纯度和偶联产物确认方法。
本页范围
本页用于梳理化学投入物和相关目录入口,不评价序列选择、生物活性、递送表现、临床适用性或法规状态。这些问题需要项目专属的实验数据支持。
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参考来源
- 1.Sustainability Challenges and Opportunities in Oligonucleotide Manufacturing (Journal of Organic Chemistry, 2021)
- 2.Solid-phase supports for oligonucleotide synthesis (Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, 2013)
- 3.The chemical evolution of oligonucleotide therapies of clinical utility (Nucleic Acids Research, 2017)
- 4.Bioconjugated Oligonucleotides: Recent Developments and Therapeutic Applications (Molecules, 2019)