如何支持项目
物料规格应分别描述正义链和反义链,并标明糖修饰、骨架连接、末端、突出端和偶联位点。
把双链拆分为两条明确的链
合成 siRNA 双链不能用一条序列表示。正义链和反义链分别具有自己的序列、末端和修饰位点图;突出端和偶联位点也必须落实到具体链和具体位置。
修饰模式取决于具体设计。公开的 2′-O-甲基和 2′-氟修饰研究表明,两条链上的修饰位置会影响稳定性和 RNAi 活性,因此不能把某个设计的修饰模式当作通用替换规则。
典型化学流程
1
定义两条链
记录正义链和反义链序列、链长、突出端及预定双链形式。
2
逐位标明修饰
把每个糖、碱基、骨架和末端修饰准确标到对应链的具体位置。
3
选择单体、载体和循环化学
根据每条链的设计匹配保护亚磷酰胺、固相载体、氧化或硫化步骤和脱保护条件。
4
分别合成和纯化两条链
在形成双链前,分别规划每条链的切割、脱保护和纯化。
5
按需引入偶联物
明确被偶联的链、连接位置、配体结构、间隔臂,以及在固相上还是合成后引入手柄。
6
形成并表征双链
将纯化后的两条链退火,并确定单链身份、纯度、双链形成和偶联物确认方法。
选料前需要提供的信息
正义链和反义链序列
提供两条链的方向和突出端;靶基因名称不能代替物料规格。
逐位修饰图
准确标明 2′-OMe、2′-F、未修饰 RNA、修饰碱基及其他残基的位置。
骨架和末端模式
标明硫代磷酸酯位置、末端磷酸或类似物,以及封闭或功能化的末端。
偶联定义
明确链、末端或内部位点、配体或脂质手柄、连接子 和反应对。
分析方案
分别确定单链、偶联物和退火双链需要完成的确认项目。
本页范围
本页只覆盖 siRNA 研究用材料和化学规划,不负责选择靶序列、预测沉默活性、确定递送路线,也不支持安全性、临床或法规结论。这些判断需要序列和项目专属的实验数据。
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参考来源
- 1.RNA interference is mediated by 21- and 22-nucleotide RNAs (Genes & Development, 2001)
- 2.RNA interference in mammalian cells by chemically-modified RNA (Nucleic Acids Research, 2003)
- 3.Multivalent N-acetylgalactosamine-conjugated siRNA localizes in hepatocytes and elicits robust RNAi-mediated gene silencing (Journal of the American Chemical Society, 2014)
- 4.Advanced siRNA Designs Further Improve In Vivo Performance of GalNAc-siRNA Conjugates (Molecular Therapy, 2018)