프로젝트 지원 방식
소재 선정은 전체 서열과 변형 맵에서 시작합니다. 이후 보호 단량체, 고체 지지체, 골격 화학, 말단 작용기, 탈보호 조건 및 분석 계획을 정합니다.
전체 공정에 따른 소재 선정
대부분의 합성 올리고뉴클레오타이드는 고체 지지체 위에서 단계적으로 조립됩니다. 포스포아미다이트 주기는 사슬이 완성될 때까지 detritylation, 결합, oxidation 또는 sulfurization, capping을 반복합니다. 변형 단량체와 기능성 작용기는 선택한 결합 및 탈보호 조건과 호환되어야 합니다.
따라서 소재 목록은 염기서열만이 아니라 전체 사슬 설계를 기준으로 작성해야 합니다. 당과 염기 변형, 골격 결합, 3′ 말단, 말단 또는 내부 접합 위치에 따라 단량체, 지지체, 시약 및 정제 전략이 달라집니다.
일반적인 화학 공정
구조 정의
서열, 사슬 형식, 당과 염기 변형, 골격 패턴, 말단 구조 및 예정된 접합 위치를 기록합니다.
단량체와 지지체 선택
필요한 3′ 말단과 예정된 절단 조건에 맞춰 보호 포스포아미다이트와 지지체 또는 링커를 선택합니다.
조립 화학 설정
변형 빌딩 블록과 호환되는 결합, oxidation 또는 sulfurization, 캡핑, detritylation 조건을 선택합니다.
절단, 탈보호 및 정제 계획
보호기 호환성을 확인하고 전장 product를 짧은 사슬 또는 불완전 탈보호 물질과 분리하는 방법을 정합니다.
필요 시 접합 및 확인
리간드 또는 기능성 작용기는 고체상 합성 중이나 합성 후에 도입할 수 있으며, 이후 동일성과 순도를 확인합니다.
소재 선정 전 필요한 정보
서열 및 변형 맵
당, 염기, 뉴클레오타이드 간 결합 및 말단 변형을 모두 표시합니다. 염기서열만으로는 충분하지 않습니다.
3′ 말단 구조
필요한 3′ 잔기 또는 기능기를 명시해야 고체 지지체나 지지체 결합 링커를 결정할 수 있습니다.
골격 패턴
Phosphodiester와 phosphorothioate 결합 위치를 표시하여 oxidation과 sulfurization 단계를 계획합니다.
접합 계획
결합 위치, 리간드 또는 표지, 스페이서, 반응쌍, 조립 및 탈보호 조건과의 호환성을 정의합니다.
분석 요구사항
연구 단계에 맞는 동일성, 순도 및 접합체 확인 방법을 설정합니다.
이 페이지의 범위
이 페이지는 화학 투입 소재와 관련 카탈로그 경로를 정리합니다. 서열 선정, 생물학적 활성, 전달 성능, 임상 적합성 또는 규제 상태를 평가하지 않으며, 이러한 판단에는 프로그램별 실험 데이터가 필요합니다.
관련 제품 카탈로그 및 기술 페이지
참고 문헌
- 1.Sustainability Challenges and Opportunities in Oligonucleotide Manufacturing (Journal of Organic Chemistry, 2021)
- 2.Solid-phase supports for oligonucleotide synthesis (Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, 2013)
- 3.The chemical evolution of oligonucleotide therapies of clinical utility (Nucleic Acids Research, 2017)
- 4.Bioconjugated Oligonucleotides: Recent Developments and Therapeutic Applications (Molecules, 2019)