프로젝트 지원 방식
소재 사양은 sense strand와 antisense strand를 구분하고 당 변형, 골격 결합, 말단, 돌출부 및 접합 위치를 각각 표시해야 합니다.
Duplex를 두 개의 명확한 strand로 정의
합성 siRNA duplex는 하나의 서열만으로 정의할 수 없습니다. Sense strand와 antisense strand는 각각 서열, 말단 및 변형 맵을 가지며, overhang과 접합 위치도 특정 strand와 위치에 지정해야 합니다.
변형 패턴은 설계에 따라 달라집니다. 2′-O-methyl과 2′-fluoro 잔기에 관한 공개 연구는 두 strand에서의 위치가 안정성과 RNAi 활성에 영향을 준다는 것을 보여줍니다. 따라서 한 설계의 패턴을 일반적인 치환 규칙으로 사용할 수 없습니다.
일반적인 화학 공정
두 strand 정의
Sense와 antisense 서열, strand 길이, 돌출부 및 예정된 duplex 형식을 기록합니다.
모든 변형 위치 표시
당, 염기, 골격 및 말단 변형을 올바른 strand의 정확한 위치에 지정합니다.
단량체, 지지체 및 주기 화학 선택
보호 포스포아미다이트, 고체 지지체, oxidation 또는 sulfurization, 탈보호 조건을 각 strand 설계에 맞춥니다.
각 strand를 별도로 합성 및 정제
Duplex 형성 전에 각 strand의 절단, 탈보호 및 정제를 계획합니다.
필요 시 접합체 도입
접합 strand, 위치, 리간드 구조, 스페이서, 고체상 또는 합성 후 도입 방식을 정의합니다.
Duplex 형성 및 특성 확인
정제된 strand를 annealing하고 strand 동일성, 순도, duplex 형성 및 접합체 확인 방법을 정합니다.
소재 선정 전 필요한 정보
Sense 및 antisense 서열
두 strand의 방향과 overhang을 제공합니다. 표적 유전자 이름만으로는 소재 사양이 되지 않습니다.
위치별 변형 맵
2′-OMe, 2′-F, 비변형 RNA, 변형 염기 및 기타 잔기의 위치를 표시합니다.
골격 및 말단 패턴
Phosphorothioate 위치, 말단 phosphate 또는 유사체, 차단 또는 기능화된 말단을 표시합니다.
접합 정의
Strand, 말단 또는 내부 위치, 리간드 또는 지질 작용기, 링커 및 반응쌍을 지정합니다.
분석 계획
각 strand, 접합 종 및 annealed duplex에 필요한 확인 항목을 정의합니다.
이 페이지의 범위
이 페이지는 siRNA 연구용 소재와 화학 계획을 다룹니다. 표적 서열 선정, silencing 활성 예측, 전달 경로 결정 또는 안전성, 임상, 규제 결론은 포함하지 않습니다.
관련 제품 카탈로그 및 기술 페이지
참고 문헌
- 1.RNA interference is mediated by 21- and 22-nucleotide RNAs (Genes & Development, 2001)
- 2.RNA interference in mammalian cells by chemically-modified RNA (Nucleic Acids Research, 2003)
- 3.Multivalent N-acetylgalactosamine-conjugated siRNA localizes in hepatocytes and elicits robust RNAi-mediated gene silencing (Journal of the American Chemical Society, 2014)
- 4.Advanced siRNA Designs Further Improve In Vivo Performance of GalNAc-siRNA Conjugates (Molecular Therapy, 2018)