프로젝트 지원 방식
선정은 E3 시스템, 양쪽 결합 방향, 링커 범위, 조립 및 시험을 정의합니다. 리간드-링커는 분해를 입증하지 않습니다.
각 빌딩 블록은 삼원 복합체 시스템의 일부
PROTAC은 표적 리간드, E3 리간드 및 링커를 포함합니다. CRBN, VHL 또는 다른 시스템에서 E3, 입체화학, 보호 및 exit 벡터를 정의합니다.
조성, 강성, 극성, 분지, 연결 및 exit 벡터는 배좌, 물성 및 기하를 바꿉니다. 문헌 예시는 시리즈의 출발점일 뿐입니다.
일반적인 절차
1
리간드 정의
동일성, 결합, 입체화학, 제약 및 결합 방향.
2
작용기 선택
상보 작용기 및 결합 순서.
3
링커 매트릭스 설계
길이, PEG/알킬, 강성, 극성, 분지 및 방향 변화.
4
단계 선택
E3 유도체, 리간드-링커, 표적-링커, 이중기능성 또는 보호 빌딩 블록.
5
특성 확인
구조, 동일성, 순도, 입체화학, 반응기, 잔류물 및 보관.
6
완전한 분해 유도체 시험
결합, 삼원 복합체, 분해, 기전, 선택성 및 기능.
필요한 정보
표적 리간드
동일성/구조, 근거, 결합 방향, 작용기 및 형태.
E3 리간드
시스템, 골격, 입체화학, 결합 방향, 보호 및 근거.
링커 매트릭스
길이, 조성, 강성, 극성, 분지, 말단 및 물성.
합성
중간체, 순서, 보호, 규모, 형태, 순도 및 분석.
생물 시험
결합, 삼원 복합체, 분해, 의존성, 선택성, 시간 및 기능.
범위
E3 유도체, 리간드-링커, 링커 및 이중기능성 중간체를 다룹니다. 결합, 삼원 복합체, 분해, 투과성, 선택성, 효능, 안전성 또는 임상·규제 적합성을 보장하지 않습니다.
핵심 고려사항
- CRBN/VHL 유도체
- PEG, 알킬 및 rigid 링커
- 리간드-링커 및 이중기능성 중간체
관련 제품 카탈로그 및 기술 페이지
참고 문헌
- 1.Catalytic in vivo protein knockdown by small-molecule PROTACs (Nature Chemical Biology, 2015)
- 2.Structural basis of PROTAC cooperative recognition for selective protein degradation (Nature Chemical Biology, 2017)
- 3.E3 Ligase Ligands in Successful PROTACs: An Overview of Syntheses and Linker Attachment Points (Frontiers in Chemistry, 2021)
- 4.Rationalizing PROTAC-Mediated Ternary Complex Formation Using Rosetta (Journal of Chemical Information and Modeling, 2021)