공정 화학

올리고뉴클레오타이드 합성

변형 단량체, 고체 지지체, 황화 시약, 캡 유사체 및 관련 oligo 합성 원료 지원.

프로젝트 지원 방식

소재 선택은 정확한 가닥 구조와 합성 주기에서 시작합니다. 단량체, 보호기, 고체 지지체, 활성화, 산화 또는 황화, 캡핑, 절단, 탈보호, 정제 및 분석이 하나의 공정으로 호환되어야 합니다.

완전한 가닥 구조와 합성 조건에서 시작

포스포아미다이트 고상 합성은 고체 지지체 결합 가닥에서 detritylation, 결합, 산화 또는 황화, capping을 반복합니다. 필요한 단량체, 고체 지지체 또는 링커, 시약과 최종 처리는 DNA, RNA, 혼합·골격 변형 가닥 및 내부·말단 기능기에 따라 달라집니다.

변형 단량체는 염기나 당 변형만으로 정의되지 않습니다. 포스포아미다이트 위치, 보호기, 입체형, 수분·용매, 순도, 보관, 활성화, 결합 시간 및 탈보호 호환성이 도입과 불순물에 영향을 주므로 예정 sequence와 주기에서 확인합니다.

일반적인 소재·화학 검토 절차

1

가닥 구조 정의

Sequence, DNA/RNA, 모든 변형, 골격, 3′/5′ 말단, 내부 작용기, 접합·labeling 위치.

2

단량체와 고체 지지체 매핑

각 포스포아미다이트를 위치에 배정하고 3′ 말단과 절단에 맞는 고체 지지체 또는 링커를 선택.

3

합성 주기 검토

Detritylation, 활성화, 시간과 당량, 캡핑, 산화/황화, 세척, 수분 민감도, 반복 호환성.

4

절단과 탈보호 계획

가닥 절단, 탈황, 제거, 이성질화 또는 민감 작용기 손상 없이 보호기를 제거.

5

정제와 분석 정의

Failure sequence, 불완전 탈보호물, PO/PS 변이체, 이성질체, adduct, 잔류 및 경로 불순물을 분리.

6

실제 맥락에서 성능 확인

대표 가닥에서 도입, crude profile, 전장 회수, 동일성, 순도 및 지정 불순물을 평가.

필요한 정보

Sequence와 변형 배치도

정확한 sequence와 각 변형 뉴클레오타이드, linkage, 말단, 스페이서, 분기, 표지, 리간드 및 위치.

합성 형식

DNA/RNA 화학, 장비, 규모, 고체 지지체와 도입량, 활성화제, 주기, 산화/황화 시약 및 시간.

절단과 탈보호

시약, 온도, 시간, 순서, on-column 처리 및 유지해야 할 기능기.

소재 규격

구조, 입체형, 분석/순도 방법, 수분, 용매, 반응기 함량, 보관, 포장 및 문서.

완성 가닥 분석

질량, 순도/전장, 필요 시 sequence, PO/PS pattern, 불순물, 잔류 및 접합체.

범위

변형 뉴클레오사이드·포스포아미다이트, 고체 지지체·링커, 황화 시약, 캡 관련 소재 및 정의된 합성 input의 선택과 합의 작업을 다룹니다. 모든 단량체, 고체 지지체, sequence, 보호 체계, platform, 규모 또는 완성 oligo 서비스를 의미하지 않으며 결합, 전장 수율, 순도, 입체 결과, 활성, 안정성 또는 규제 상태를 보장하지 않습니다.

관련 제품 카탈로그 및 기술 페이지

참고 문헌

  1. 1.Deoxynucleoside phosphoramidites—A new class of key intermediates for deoxypolynucleotide synthesis (Tetrahedron Letters, 1981)
  2. 2.Synthesis of deoxyoligonucleotides on a polymer support (Journal of the American Chemical Society, 1981)
  3. 3.New nucleoside phosphoramidites and coupling protocols for solid-phase RNA synthesis (The Journal of Organic Chemistry, 1991)
  4. 4.Phosphorothioate Oligonucleotides with Low Phosphate Diester Content: Greater than 99.9% Sulfurization Efficiency with Aged Solutions of PADS (Organic Process Research & Development, 2004)