プロジェクトへの支援内容
材料選択は正確な鎖構造と合成 サイクル から始めます。モノマー、保護基、固相担体、活性化、酸化または硫化、キャッピング、切断、脱保護、精製、分析を一つの工程として適合させます。
完全な鎖構造と合成条件から開始
ホスホロアミダイト 固相合成では、固相担体 上の鎖に対して detritylation、カップリング、酸化または硫化、キャッピング を反復します。必要な モノマー、固相担体 または リンカー、試薬、最終処理は、DNA、RNA、混合・骨格修飾鎖、内部・末端官能基の有無で変わります。
修飾 モノマー は塩基や糖修飾だけでは定義できません。ホスホロアミダイト 位置、保護基、立体形、含水・溶媒、純度、保存、活性化、カップリング 時間、脱保護適合性が導入率と不純物を変えるため、予定配列と サイクル で確認します。
一般的な材料・化学レビュー
鎖構造を定義
配列、DNA/RNA、全修飾、骨格、3′/5′末端、内部 反応性官能基、コンジュゲーション・labeling 位置。
モノマー と 固相担体 を対応
各 ホスホロアミダイト を位置に割り当て、3′末端と切断条件に合う 固相担体 または リンカー を選択。
合成 サイクル を確認
Detritylation、活性化、時間と当量、キャッピング、酸化/硫化、洗浄、水分感受性、反復適合性。
切断と脱保護を設計
鎖切断、脱硫、脱離、異性化、感受性 反応性官能基 の損傷を避けて保護基を除去。
精製と分析を定義
Failure sequence、不完全脱保護物、PO/PS バリアント、異性体、adduct、残留、ルート不純物を分離。
実配列で性能確認
代表鎖で導入、粗 profile、全長 回収、同一性、純度、指定不純物を評価。
必要な情報
配列と修飾 配置図
正確な配列と各修飾 nucleotide、linkage、末端、スペーサー、分岐、標識、リガンド、位置。
合成形式
DNA/RNA chemistry、装置、scale、固相担体 と 導入量、activator、サイクル、酸化/硫化試薬、時間。
切断と脱保護
試薬、温度、時間、順序、on-column 処理、保持すべき官能基。
材料仕様
構造、立体形、測定/純度法、水分、溶媒、反応基含量、保存、包装、文書。
完成鎖の分析
質量、純度/全長、必要時の配列、PO/PS pattern、不純物、残留、コンジュゲート。
範囲
修飾 ヌクレオシド・ホスホロアミダイト、固相担体・リンカー、硫化試薬、キャップ 関連材料、その他定義済み 原料 の選択と合意作業を対象とします。全 モノマー、固相担体、配列、保護系、platform、scale、完成 oligo サービスを意味せず、カップリング、全長 収率、純度、立体結果、活性、安定性、規制状態を保証しません。
関連する製品カタログと技術ページ
参考文献
- 1.Deoxynucleoside phosphoramidites—A new class of key intermediates for deoxypolynucleotide synthesis (Tetrahedron Letters, 1981)
- 2.Synthesis of deoxyoligonucleotides on a polymer support (Journal of the American Chemical Society, 1981)
- 3.New nucleoside phosphoramidites and coupling protocols for solid-phase RNA synthesis (The Journal of Organic Chemistry, 1991)
- 4.Phosphorothioate Oligonucleotides with Low Phosphate Diester Content: Greater than 99.9% Sulfurization Efficiency with Aged Solutions of PADS (Organic Process Research & Development, 2004)