プロジェクトへの支援内容
材料選定は完全な鎖設計、つまり配列、位置別修飾、骨格、3′ 固相担体、末端、内部 反応性官能基、切断、脱保護、分析から始めます。
鎖設計を材料要件に変換
修飾名だけではオリゴを定義できません。各残基を位置と鎖に割り当て、骨格、末端、オーバーハング、固相担体/3′ リンカー、コンジュゲーション部位も指定します。
保護モノマー、固相担体、酸化/硫化、キャッピング、切断、脱保護は互換である必要があります。色素、脂質、GalNAc、コレステロール、クリック は 固相担体、保護、精製、分析も変えます。
一般的な定義ワークフロー
1
各鎖を定義
配列、方向、役割、長さ、オーバーハング、形式。
2
修飾を配置
糖、塩基、骨格、立体化学、末端、内部修飾を正確に割り当てます。
3
モノマーと 固相担体 を選択
ホスホロアミダイト 等と 固相担体/3′ リンカー を 構造 に合わせます。
4
サイクル と脱保護を設定
カップリング、キャッピング、酸化/硫化、切断、脱保護の互換性を確認します。
5
コンジュゲーションを計画
リガンド/標識分子、位置、スペーサー、反応対、段階、精製を定義します。
6
分析を定義
同一性、純度、質量、修飾、関連物質、duplex、材料形態。
選定前に必要な情報
完全な設計図
配列と糖、塩基、骨格、末端、オーバーハング、結合位置。
合成形式
DNA、RNA、混合、鎖数、scale、固相担体/3′、形態。
工程制約
保護、活性化、酸化/硫化、切断、脱保護、溶媒、温度。
コンジュゲート
正確な リガンド、脂質、色素、biotin、キレート剤、クリック 反応性官能基、位置、スペーサー、順序。
分析仕様
同一性、純度、質量、修飾、残留、対イオン、水分、保存。
本プラットフォームの範囲
モノマー、固相担体、合成試薬、反応性官能基、コンジュゲーションビルディングブロックを対象とします。配列設計、標的選定、活性予測、検証済み デリバリー、有効性、安全性、臨床・規制適合性は対象外です。
主な検討事項
- 2'-OMe、2'-F、LNA、MOE 関連ビルディングブロック
- 骨格・末端修飾
- GalNAc、脂質、色素、クリック 反応性官能基
関連する製品カタログと技術ページ
参考文献
- 1.Sustainability Challenges and Opportunities in Oligonucleotide Manufacturing (Journal of Organic Chemistry, 2021)
- 2.Solid-phase supports for oligonucleotide synthesis (Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, 2013)
- 3.The chemical evolution of oligonucleotide therapies of clinical utility (Nucleic Acids Research, 2017)
- 4.Bioconjugated Oligonucleotides: Recent Developments and Therapeutic Applications (Molecules, 2019)